Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 FAM133A-202ENST00000332647 3159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 UGT2A3-201ENST00000251566 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-837P-201ENST00000391056 108 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SNORD108-201ENST00000459332 71 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC010680.3-201ENST00000604215 520 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 COPS2-202ENST00000388901 6628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-181P-201ENST00000363225 107 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC091286.1-201ENST00000431233 461 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL627309.4-201ENST00000496488 457 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 THAP6-203ENST00000502620 582 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC008083.3-201ENST00000547777 329 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SCEL-201ENST00000349847 2386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
TCIRG1Q13488 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
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