Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 OBSCN-205ENST00000422127 24060 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 XRN1-201ENST00000264951 10143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SMAD4Q13485 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 XIST-204ENST00000429829 19275 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-39P-201ENST00000384344 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PTPRG-AS1-210ENST00000498655 547 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MGST1-215ENST00000540056 546 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC01479-201ENST00000545520 509 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 FKBP1BP1-201ENST00000553366 325 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL031595.2-201ENST00000624215 19071 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC007529.1-201ENST00000418574 2178 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ELOVL7-203ENST00000505959 4165 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 MIPOL1-204ENST00000539062 2389 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC011460.1-201ENST00000636268 1834 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC009902.3-201ENST00000606235 2172 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 ZIC4-AS1-201ENST00000462168 268 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC022634.1-201ENST00000520765 532 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 XIAPP1-201ENST00000603162 600 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SMAD4Q13485 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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