Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 COX5BP7-201ENST00000414780 274 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPL7AP49-201ENST00000429522 581 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL591438.1-201ENST00000433508 581 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LINC00492-201ENST00000504436 593 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL160237.1-201ENST00000554526 572 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Y_RNA.474-201ENST00000384341 102 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPS15AP36-201ENST00000492022 382 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC092542.1-201ENST00000513155 355 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC093249.4-201ENST00000564755 259 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ANO6-205ENST00000441606 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 OR2L3-202ENST00000641161 2830 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 OR2L3-203ENST00000641649 2846 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC073136.1-201ENST00000449426 2884 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 Z95331.1-201ENST00000623075 23112 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RAD51AP1-202ENST00000352618 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RNU2-36P-201ENST00000410361 191 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 MIR4512-201ENST00000583257 77 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
SF3B2Q13435 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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