Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL392048.1-201ENST00000613946 534 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.18□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RSL24D1P3-201ENST00000449255 495 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC00973-201ENST00000473756 962 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MS4A4E-206ENST00000528394 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AP000756.1-201ENST00000532606 679 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC012170.2-201ENST00000560380 667 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC018554.1-201ENST00000565506 800 ntTSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC079228.1-201ENST00000624774 1049 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.17□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNF17-204ENST00000339524 2203 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
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MSLNQ13421 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
MSLNQ13421 AGGF1P5-201ENST00000567900 919 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
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