Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RNU6-398P-201ENST00000384143 109 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MIR1911-201ENST00000410783 80 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RPEP3-201ENST00000425462 676 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL691497.1-201ENST00000443270 449 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC007967.1-201ENST00000455422 1159 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 EIF4EP3-201ENST00000498782 656 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 NDUFB4P9-201ENST00000511646 388 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
SP140Q13342 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
SP140Q13342 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MIR448-201ENST00000362131 111 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNA5SP505-201ENST00000364748 108 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RN7SKP159-201ENST00000410657 292 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TMSB10P2-201ENST00000416049 131 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC007686.1-201ENST00000488511 463 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 BACH1-IT1-201ENST00000504298 821 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC008574.1-201ENST00000514240 433 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 Vault.1-201ENST00000516474 102 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 LINC01405-202ENST00000547607 674 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC025043.1-201ENST00000558047 625 ntTSL 2 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
SP140Q13342 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
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