Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL807761.1-201ENST00000417622 171 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 TCF7L1-IT1-201ENST00000433581 458 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02045-201ENST00000460324 679 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02272-202ENST00000511399 607 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC095057.2-201ENST00000515422 553 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC023161.2-201ENST00000551218 780 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL357094.1-201ENST00000603845 844 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 C8orf59-208ENST00000612809 475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MTND1P37-201ENST00000636562 264 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 GPC5-IT1-201ENST00000416664 658 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC007566.1-201ENST00000427458 643 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 MACC1-AS1-201ENST00000439285 639 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC138853.1-201ENST00000503549 823 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02465-202ENST00000508724 503 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC02014-201ENST00000514010 713 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC034105.3-201ENST00000565294 442 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CBX3Q13185 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms