Protein–RNA interactions for Protein: Q13133

NR1H3, Oxysterols receptor LXR-alpha, humanhuman

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Length 447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H3Q13133 KCNJ10-205ENST00000638728 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PIGN-241ENST00000640050 3154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PTBP3-207ENST00000458258 7995 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PRTG-201ENST00000389286 11967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MBNL1-203ENST00000324196 5225 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 IPO11-203ENST00000409534 1725 ntTSL 2 BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC5.82□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ACE2-201ENST00000252519 3393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF571-201ENST00000328550 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LMO3-209ENST00000447609 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 TESPA1-203ENST00000524622 4188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF285B-201ENST00000561698 1767 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNY3P11-201ENST00000364153 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC103855.1-201ENST00000525926 564 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNORD39.4-201ENST00000620099 78 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 PTPRC-209ENST00000442510 5164 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SEC31A-226ENST00000508479 3397 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC092376.2-201ENST00000622621 4116 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LIX1-AS1-201ENST00000504578 1793 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 CYP3A43-204ENST00000354829 1709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF567-203ENST00000585696 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 OR5K1-202ENST00000642057 3466 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 TNRC6B-201ENST00000301923 15958 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 C4BPAP1-201ENST00000415474 1893 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SCN2A-203ENST00000375437 8792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ATP6V1G1P7-201ENST00000415853 349 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AP001085.1-201ENST00000524441 639 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NR1H3Q13133 MIR4660-201ENST00000583549 74 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 NR2C2-213ENST00000617312 8113 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZNF343-207ENST00000612935 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 AASDH-201ENST00000205214 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MAPK10-338ENST00000641647 3362 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 UBE2W-207ENST00000602593 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SLC28A3-201ENST00000376238 4887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 TTC39C-201ENST00000304621 2304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 ZBTB38-202ENST00000441582 3662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NR1H3Q13133 RNU4-50P-201ENST00000364361 141 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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