Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC068790.3-201ENST00000602988 553 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 DEFB110-201ENST00000371148 384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC02095-201ENST00000430908 346 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ZNF114P1-201ENST00000453500 292 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL359095.1-201ENST00000457383 635 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MTCO2P6-201ENST00000463134 685 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RN7SL293P-201ENST00000481765 281 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL137804.1-201ENST00000528872 576 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 IQCH-201ENST00000335894 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 FASTKD1-205ENST00000453929 2791 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 FKTN-204ENST00000448551 1700 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 PCDH11X-208ENST00000504220 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 OR9G4-204ENST00000641668 2608 ntAPPRIS P1 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TXNP7-201ENST00000406296 293 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL390962.1-201ENST00000421507 526 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 TAAR7P-201ENST00000436141 242 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AL034349.1-201ENST00000458367 549 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 AC093292.1-201ENST00000505050 449 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
CHAF1BQ13112 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
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