Protein–RNA interactions for Protein: Q13033

STRN3, Striatin-3, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN3Q13033 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 CLCA2-201ENST00000370565 4025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 OR1C1-202ENST00000641256 3719 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 LINC02458-201ENST00000500381 2941 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 MCCC1-AS1-201ENST00000471731 765 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 HSPD1P15-201ENST00000505573 1122 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 LINC02174-201ENST00000508977 553 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC098848.1-201ENST00000588466 567 ntTSL 4 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 KMO-204ENST00000366559 5261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AL591441.1-201ENST00000618108 2247 ntTSL 2 BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 HSPD1P16-201ENST00000402302 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 DYDC1-203ENST00000421924 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC105399.1-201ENST00000422418 418 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AL157882.1-201ENST00000447148 429 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC010285.1-201ENST00000470580 392 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 AC093788.1-201ENST00000609356 927 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
STRN3Q13033 R3HCC1L-205ENST00000612478 3337 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 186.9 ms