Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 SCN11A-203ENST00000456224 5262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 PLCB1-210ENST00000612075 6576 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 CLDND1-208ENST00000503004 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 SNORD62.1-201ENST00000362541 86 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 KRTAP8-2P-201ENST00000440620 186 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RN7SL172P-201ENST00000460535 303 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 TM4SF1-AS1-202ENST00000496491 754 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AP002768.1-201ENST00000526741 320 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 ZNF84-212ENST00000542874 540 ntTSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC026620.1-201ENST00000584815 326 ntTSL 3 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 VPS13D-213ENST00000613099 16245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 TEX30-201ENST00000376019 1689 ntTSL 2 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 SOCS5P3-201ENST00000425115 1576 ntBASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 PCAT14-202ENST00000627127 3935 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 MIR223-201ENST00000385204 110 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 Z86062.2-201ENST00000411442 380 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 DDX39BP1-205ENST00000422507 192 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RPL7AP61-201ENST00000443410 636 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC017101.1-201ENST00000453665 571 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 LINC01933-204ENST00000524295 3591 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL033384.1-202ENST00000431554 3104 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 ERC2-201ENST00000288221 6138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 ZNF83-203ENST00000541777 3743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 FUT9-201ENST00000302103 12783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 NXT2-201ENST00000218004 2692 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 AL731532.2-201ENST00000623542 1953 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 MTUS1-201ENST00000262102 6160 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 FAM71D-211ENST00000612183 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
RNF20Q5VTR2 LINC00308-201ENST00000419431 727 ntTSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 220.4 ms