Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 PP2D1-202ENST00000389050 2151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 NAALADL2-203ENST00000454872 9865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC092813.2-201ENST00000434540 399 ntTSL 3 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC021087.2-201ENST00000504656 1203 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC007536.1-201ENST00000533382 349 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC104781.1-201ENST00000449838 397 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC124069.1-201ENST00000517454 735 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC011124.1-204ENST00000522265 562 ntTSL 4 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 TRAV28-201ENST00000557548 323 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
LAMA3Q16787 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.59□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 OR6C65-201ENST00000379665 1076 ntAPPRIS P1 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL389895.1-201ENST00000554127 252 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RNA5SP62-201ENST00000363457 110 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
LAMA3Q16787 IFI16-205ENST00000368132 2704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
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