Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 GAS5-218ENST00000448718 565 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RN7SKP183-201ENST00000517169 324 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC084855.1-201ENST00000528696 572 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC134511.1-201ENST00000535721 192 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AF123462.1-201ENST00000554307 446 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PINLYP-205ENST00000569031 557 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 FKBP1AP1-201ENST00000594588 318 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MIR6889-201ENST00000613185 59 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MBNL2-204ENST00000397601 4487 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AASDH-202ENST00000451613 3182 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PHC3-217ENST00000497658 2087 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SAMD9L-202ENST00000411955 5831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ZNF436-201ENST00000314011 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNA5SP431-201ENST00000410312 120 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Y_RNA.602-201ENST00000410535 92 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL354868.1-201ENST00000417077 482 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC113412.1-201ENST00000425840 504 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL160004.1-201ENST00000434311 478 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RPS4XP1-201ENST00000482189 787 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNA5SP340-201ENST00000517132 107 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC021006.3-201ENST00000530771 192 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC068789.1-201ENST00000547942 577 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL162431.4-201ENST00000604674 411 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL109954.2-201ENST00000611020 530 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MAPKBP1-217ENST00000627631 210 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC010127.1-209ENST00000447809 2305 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 GABRA1-215ENST00000636573 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC068775.1-202ENST00000538173 1602 ntAPPRIS P1 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LEPR-208ENST00000616738 5081 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ATXN2-215ENST00000542287 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LRRC49-223ENST00000560369 2586 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC090826.1-202ENST00000562009 3337 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC019080.1-201ENST00000397057 5202 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RAD17-220ENST00000616683 3057 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC007557.3-201ENST00000418591 3135 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 HNF4G-203ENST00000396423 4209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ODF3-202ENST00000342593 386 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC092687.1-201ENST00000418835 389 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 CRIP1P1-201ENST00000427567 185 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 GAPDHP48-201ENST00000436626 961 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PPIAP27-201ENST00000453800 265 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC096577.1-202ENST00000515649 448 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC010186.2-204ENST00000537668 439 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 PWRN1-204ENST00000565241 480 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
E2F4Q16254 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms