Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 NDUFB4P2-201ENST00000509515 391 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC100768.1-201ENST00000525512 506 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC093838.1-201ENST00000613014 469 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC080188.3-201ENST00000624842 748 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 GNGT1-201ENST00000248572 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MDM2-205ENST00000348801 798 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 TMCO2-201ENST00000372766 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR144-201ENST00000384886 86 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL121882.1-201ENST00000422893 417 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LINC00278-202ENST00000444263 587 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 GXYLT1P1-201ENST00000446657 490 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC016696.1-201ENST00000446949 318 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 ZFPM2-AS1-204ENST00000520433 748 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AP002748.2-201ENST00000528671 348 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC009117.2-201ENST00000565374 504 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR5195-201ENST00000583555 115 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL161782.1-201ENST00000622930 586 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC024341.1-201ENST00000526444 1552 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USF2Q15853 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 RPL7P25-201ENST00000404151 721 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC005326.1-201ENST00000429197 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 COX6CP12-201ENST00000446748 202 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL133330.2-201ENST00000532760 776 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC025281.1-201ENST00000567026 265 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL022067.1-201ENST00000602426 454 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AL606834.2-201ENST00000602954 668 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 DUXAP11-201ENST00000603858 526 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
USF2Q15853 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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