Protein–RNA interactions for Protein: Q15825

CHRNA6, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA6Q15825 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 HIGD1AP13-201ENST00000509878 289 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 CYB5AP5-201ENST00000549779 389 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 LARP7P2-201ENST00000575306 125 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC090330.1-201ENST00000588646 764 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC068880.4-201ENST00000623082 495 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 OR4G11P-202ENST00000642116 1414 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 TFEC-202ENST00000320239 6605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RNU2-47P-201ENST00000410649 186 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AL390023.1-201ENST00000428836 262 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 ACBD3-AS1-201ENST00000440540 535 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 HPRT1P3-201ENST00000539521 576 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 LINC00871-202ENST00000556071 554 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC005776.1-201ENST00000603164 290 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC084824.5-201ENST00000612009 413 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 LINC01419-201ENST00000522365 1521 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 Y_RNA.110-201ENST00000363220 99 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CHRNA6Q15825 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.5 ms