Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 AC241520.1-201ENST00000422654 1099 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
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NCOA1Q15788 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NCOA1Q15788 NDUFAF4-201ENST00000316149 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
NCOA1Q15788 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
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