Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 OR8K4P-201ENST00000534608 872 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MTND4P24-201ENST00000424002 397 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 TPTE2P1-204ENST00000435256 593 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC103783.1-201ENST00000520506 373 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 PIGY-201ENST00000527353 217 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC078814.3-201ENST00000553036 491 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC136601.2-201ENST00000604356 474 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC055876.5-201ENST00000605667 259 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 FRG1HP-204ENST00000617940 757 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNU6-461P-201ENST00000364195 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 PNRC2P1-201ENST00000423940 420 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RPP40P1-201ENST00000426762 456 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 HMGN3P1-201ENST00000453847 193 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 AC021549.1-201ENST00000580937 433 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 BX322635.1-201ENST00000605804 496 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC016542.1-201ENST00000608259 493 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 AC092608.2-201ENST00000624427 218 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ZNF470-202ENST00000391709 6601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RPL7L1P10-201ENST00000427790 463 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC092573.2-201ENST00000434546 243 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RPL32P28-201ENST00000443577 397 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL451164.2-201ENST00000445932 597 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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