Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 SPRR2D-203ENST00000368757 800 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RN7SKP83-201ENST00000516512 178 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 NAT2-202ENST00000520116 716 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 LINC01467-201ENST00000554211 1187 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL603758.1-201ENST00000618654 241 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL159972.1-201ENST00000625150 448 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 ANKRD26P2-201ENST00000445530 1710 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 SNORA73.2-201ENST00000364946 201 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RNU6-723P-201ENST00000383973 107 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MIR449B-201ENST00000384995 97 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC007066.1-201ENST00000392902 381 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 LINC01510-203ENST00000458082 626 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 RN7SKP209-201ENST00000516888 304 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 CUL4B-202ENST00000371322 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 IL2-201ENST00000226730 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
PDE1CQ14123 SNORA36C-201ENST00000384289 132 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms