Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC01378-202ENST00000437514 783 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL139081.1-201ENST00000452207 382 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNU6-928P-201ENST00000516876 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC02448-201ENST00000548613 583 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL035413.2-201ENST00000604801 525 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL136363.1-201ENST00000605349 337 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL450472.3-201ENST00000615578 367 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AP000943.4-201ENST00000622912 357 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 HMGN5-201ENST00000358130 2126 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL589765.2-201ENST00000420382 424 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ARL13A-202ENST00000450049 1102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 NDUFS5P6-201ENST00000529136 295 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 OR4R2P-201ENST00000530815 597 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC124947.2-202ENST00000552735 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC013553.2-201ENST00000604244 589 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
DDX39BQ13838 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.96
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