Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LINC01216-201ENST00000515728 824 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU6-711P-201ENST00000517255 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ATP5F1P1-201ENST00000433775 569 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC006249.1-201ENST00000621223 471 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL357052.1-201ENST00000443504 381 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RPL21P66-201ENST00000426566 466 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LAMTOR3P1-201ENST00000428620 370 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 FAM92A1P1-201ENST00000528023 890 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC120053.1-201ENST00000607706 736 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC023490.1-202ENST00000620909 820 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL118508.4-201ENST00000624142 1176 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LINC02070-201ENST00000460586 1321 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL138880.1-201ENST00000405824 642 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC025918.2-201ENST00000558683 763 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC091953.2-201ENST00000623979 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LRRC70-201ENST00000334994 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 SSR3-208ENST00000496050 579 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CACNA1SQ13698 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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