Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 MCMDC2-201ENST00000313616 2043 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC111000.5-201ENST00000506559 1178 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 ARL2BPP2-201ENST00000550907 489 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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TCOF1Q13428 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 LINC02241-202ENST00000512688 467 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC069549.1-201ENST00000451584 499 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC010273.2-201ENST00000479830 438 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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TCOF1Q13428 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
TCOF1Q13428 AC093689.1-203ENST00000505967 299 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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TCOF1Q13428 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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TCOF1Q13428 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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TCOF1Q13428 SYF2P1-201ENST00000550658 413 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
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TCOF1Q13428 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
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TCOF1Q13428 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 RPL23AP39-201ENST00000415533 405 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 GIN1-203ENST00000508629 1040 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AL353811.1-202ENST00000602614 618 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 AP003072.5-201ENST00000623872 773 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
TCOF1Q13428 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
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