Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 GLYCAM1-201ENST00000546596 285 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC103957.1-201ENST00000517681 503 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC007687.1-201ENST00000602704 304 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
ATMQ13315 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL121821.2-201ENST00000556081 394 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 STAT4-203ENST00000409995 709 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL353093.1-201ENST00000441292 436 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 NIFKP8-201ENST00000560500 874 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 RNA5SP257-201ENST00000363023 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC106745.1-201ENST00000566798 464 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 NF1-214ENST00000490416 1329 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 BCL2L15-203ENST00000393320 276 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
ATMQ13315 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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