Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AL158050.1-201ENST00000416077 457 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC004866.2-201ENST00000438285 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 CDC42P1-201ENST00000456658 548 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC133134.1-201ENST00000466800 359 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNU6-1102P-201ENST00000516149 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 IL21-202ENST00000611104 707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 MTND4P21-201ENST00000453886 1357 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNU6-251P-201ENST00000363235 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 TAS2R15P-201ENST00000390674 928 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL356320.2-201ENST00000417263 507 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL109741.2-201ENST00000455561 343 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SNORA70.16-201ENST00000516390 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AP003485.2-201ENST00000623636 610 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SKP2Q13309 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MTCO2P17-201ENST00000424336 677 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC00412-201ENST00000444744 420 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RPL37P25-201ENST00000507308 276 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 MIR3609-201ENST00000582661 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
SKP2Q13309 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.6 ms