Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AL359265.3-201ENST00000456125 579 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC007527.1-201ENST00000535528 313 ntTSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC021979.1-201ENST00000553822 336 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC027808.1-201ENST00000560873 683 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC090621.1-201ENST00000592121 419 ntTSL 3 BASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC6.4□□□□□ -1.38
PTGDRQ13258 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 YWHAZ-211ENST00000457309 3007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 OR8H2-201ENST00000313503 3088 ntAPPRIS P2 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 SRRM1P3-201ENST00000426911 2678 ntBASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 DAB2-209ENST00000509337 2740 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RAD17-201ENST00000282891 2135 ntTSL 1 (best) BASIC6.4□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 NDRG3-201ENST00000349004 2964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 LINC01981-201ENST00000432163 2833 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 OR4F13P-202ENST00000560066 2054 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AF186996.5-201ENST00000418098 904 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ARHGEF7-AS1-201ENST00000435037 321 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC017074.2-201ENST00000439382 607 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 TPT1P13-201ENST00000449760 499 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL445665.1-202ENST00000452436 324 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AP000797.2-201ENST00000475768 606 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 LINC02137-203ENST00000567448 930 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC005856.1-201ENST00000585921 286 ntTSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 PACRG-210ENST00000611387 279 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 MGAM2-201ENST00000477922 7867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 TRIQK-223ENST00000537541 3510 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 KYAT3-203ENST00000370491 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.39□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 CAPRIN2-203ENST00000417045 3535 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 R3HDM1-202ENST00000409478 4272 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 DNM1P47-202ENST00000561463 15043 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ZNF268-205ENST00000536435 13475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RNA5SP242-201ENST00000364171 118 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RNA5SP131-201ENST00000365452 119 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 NME1P1-201ENST00000420914 382 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AP001476.3-201ENST00000429512 415 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 FTLP19-201ENST00000433300 394 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 RNU6-615P-201ENST00000516065 106 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
PTGDRQ13258 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC6.38□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.6 ms