| CNTN1 | Q12860 | AF001550.1-201 | ENST00000572747 | 573 nt | TSL 4 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MIR4325-201 | ENST00000583049 | 90 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MYL12B-204 | ENST00000584539 | 1064 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | VN1R90P-201 | ENST00000595717 | 726 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | VN1R92P-201 | ENST00000598511 | 928 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC010320.2-202 | ENST00000599125 | 595 nt | TSL 4 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AF131215.7-201 | ENST00000602443 | 707 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC024560.3-201 | ENST00000608482 | 349 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL590282.1-201 | ENST00000610379 | 1136 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC245297.3-203 | ENST00000612135 | 405 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | THOC1-220 | ENST00000621904 | 1083 nt | TSL 5 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL356585.4-201 | ENST00000623078 | 1229 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA50A-202 | ENST00000629536 | 136 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL121759.2-201 | ENST00000636173 | 570 nt | TSL 4 BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007496.3-201 | ENST00000624987 | 3443 nt | BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CREBRF-201 | ENST00000296953 | 7778 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | BLM-208 | ENST00000560509 | 3966 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | GPR18-203 | ENST00000397473 | 1660 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.24 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PPP2R5C-226 | ENST00000557095 | 1307 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU1-75P-201 | ENST00000347264 | 129 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-289P-201 | ENST00000364093 | 107 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SNORA51.2-201 | ENST00000364595 | 132 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | C1orf189-201 | ENST00000368525 | 387 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | BCLAF3-202 | ENST00000379682 | 3217 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL356131.1-201 | ENST00000405826 | 414 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC083875.1-201 | ENST00000419509 | 405 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC099677.1-201 | ENST00000420575 | 175 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPS15AP6-201 | ENST00000420703 | 385 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC004946.1-201 | ENST00000421825 | 751 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL080248.1-201 | ENST00000428954 | 388 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL035407.1-201 | ENST00000429211 | 571 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | OPA1-AS1-201 | ENST00000433105 | 492 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC016644.1-201 | ENST00000438553 | 434 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL117351.1-201 | ENST00000438864 | 766 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL513422.1-201 | ENST00000449531 | 383 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL7P23-201 | ENST00000493874 | 747 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LINC02484-202 | ENST00000514877 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-1129P-201 | ENST00000515964 | 104 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNA5SP216-201 | ENST00000516111 | 123 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CTHRC1-204 | ENST00000520880 | 560 nt | TSL 4 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC069120.1-201 | ENST00000521623 | 379 nt | TSL 3 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | DEFB130C-201 | ENST00000528518 | 237 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC013799.1-201 | ENST00000531157 | 348 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC018630.1-201 | ENST00000541376 | 925 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | OR7K1P-201 | ENST00000546439 | 926 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093012.1-203 | ENST00000548437 | 450 nt | TSL 2 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC090888.2-201 | ENST00000559765 | 1144 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC002400.1-201 | ENST00000569310 | 726 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ISCA1P3-201 | ENST00000577104 | 373 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC090615.1-201 | ENST00000577519 | 154 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZEB2-AS1-204 | ENST00000595109 | 855 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL139344.1-201 | ENST00000605228 | 195 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL162274.2-201 | ENST00000614406 | 332 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC131159.1-201 | ENST00000621854 | 213 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC018692.3-201 | ENST00000623929 | 123 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC093010.3-201 | ENST00000570269 | 15214 nt | BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZNF804A-202 | ENST00000613975 | 3986 nt | TSL 5 BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | PIK3C2G-201 | ENST00000266497 | 4764 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.23 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | EYS-204 | ENST00000370621 | 10485 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ISPD-AS1-202 | ENST00000438573 | 2252 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RICTOR-201 | ENST00000296782 | 7505 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CXCL10-201 | ENST00000306602 | 1176 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RPL21P132-201 | ENST00000331267 | 462 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-433P-201 | ENST00000363216 | 104 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | Y_RNA.234-201 | ENST00000364409 | 97 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL590084.2-201 | ENST00000401481 | 382 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | MOB4-205 | ENST00000409916 | 829 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007899.1-201 | ENST00000412776 | 775 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC011233.1-201 | ENST00000422812 | 283 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | BX890604.2-201 | ENST00000427883 | 474 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL139118.1-201 | ENST00000432707 | 446 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL591721.1-201 | ENST00000439849 | 751 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ARPC3P2-201 | ENST00000457786 | 533 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LEKR1-206 | ENST00000483177 | 546 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | HMGB1P36-201 | ENST00000487709 | 576 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | LNX1-AS2-201 | ENST00000502410 | 347 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC096751.1-202 | ENST00000502691 | 1067 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC024589.1-201 | ENST00000512207 | 263 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNA5SP341-201 | ENST00000516261 | 117 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC091996.1-201 | ENST00000522274 | 600 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | DUXAP5-201 | ENST00000529668 | 529 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC022240.1-201 | ENST00000532065 | 684 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CCDC179-202 | ENST00000532798 | 791 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CR383656.7-201 | ENST00000548164 | 174 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ZNF192P1-203 | ENST00000565888 | 810 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC007598.2-201 | ENST00000569490 | 539 nt | TSL 3 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC090616.5-201 | ENST00000581225 | 299 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL353997.4-201 | ENST00000586196 | 166 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | SATB1-AS1-207 | ENST00000593741 | 955 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC106791.2-201 | ENST00000604680 | 391 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC090186.1-201 | ENST00000605991 | 572 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RNU6-88P-201 | ENST00000606801 | 100 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ADARB1-213 | ENST00000611195 | 159 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | RASSF8-215 | ENST00000611440 | 852 nt | TSL 5 BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC008147.4-201 | ENST00000617570 | 1204 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AC138932.5-201 | ENST00000617759 | 563 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | AL353748.2-201 | ENST00000622148 | 471 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | CRYM-AS1-204 | ENST00000637983 | 556 nt | BASIC | 3.22 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | ATF2-221 | ENST00000538946 | 1325 nt | TSL 5 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.89 | | |
| CNTN1 | Q12860 | OR6C1-202 | ENST00000642104 | 2055 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.21 | □□□□□ -1.89 | | |