Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AF001550.1-201ENST00000572747 573 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 VN1R90P-201ENST00000595717 726 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AF131215.7-201ENST00000602443 707 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL590282.1-201ENST00000610379 1136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.24□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 PPP2R5C-226ENST00000557095 1307 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 C1orf189-201ENST00000368525 387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 BCLAF3-202ENST00000379682 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC099677.1-201ENST00000420575 175 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL080248.1-201ENST00000428954 388 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL035407.1-201ENST00000429211 571 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CTHRC1-204ENST00000520880 560 ntTSL 4 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC018630.1-201ENST00000541376 925 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL139344.1-201ENST00000605228 195 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.23□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ISPD-AS1-202ENST00000438573 2252 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-433P-201ENST00000363216 104 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 MOB4-205ENST00000409916 829 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC011233.1-201ENST00000422812 283 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 HMGB1P36-201ENST00000487709 576 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC096751.1-202ENST00000502691 1067 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC024589.1-201ENST00000512207 263 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ZNF192P1-203ENST00000565888 810 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC007598.2-201ENST00000569490 539 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL353997.4-201ENST00000586196 166 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC106791.2-201ENST00000604680 391 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AC138932.5-201ENST00000617759 563 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.89
CNTN1Q12860 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.6 ms