Protein–RNA interactions for Protein: Q12830

BPTF, Nucleosome-remodeling factor subunit BPTF, humanhuman

Predictions only

Length 3,046 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BPTFQ12830 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 IGHV3-76-201ENST00000522465 295 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
BPTFQ12830 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 XKRY2-201ENST00000442362 1093 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 SSXP1-201ENST00000453640 473 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC022390.1-201ENST00000517854 434 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 LINC02546-202ENST00000528119 801 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 UBE2V2P1-201ENST00000434717 398 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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BPTFQ12830 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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BPTFQ12830 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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BPTFQ12830 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 HMGN1P8-201ENST00000463578 288 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
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BPTFQ12830 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
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BPTFQ12830 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 USP9YP10-201ENST00000454868 628 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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BPTFQ12830 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 LINC01085-201ENST00000502759 1984 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC092138.2-201ENST00000563811 428 ntTSL 5 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.81□□□□□ -2.12
BPTFQ12830 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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