Protein–RNA interactions for Protein: Q12769

NUP160, Nuclear pore complex protein Nup160, humanhuman

Predictions only

Length 1,436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP160Q12769 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RPL5P13-201ENST00000462840 709 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC022616.2-201ENST00000523185 300 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AP000873.2-205ENST00000529031 435 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LINC01578-206ENST00000555520 977 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC008764.2-201ENST00000597226 376 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 CNOT6LP1-201ENST00000559681 1462 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 ATP6V1G3-202ENST00000309309 678 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 SSXP4-201ENST00000451349 245 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 CBX3P4-201ENST00000538909 354 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 BUD31P2-201ENST00000449374 300 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC025857.1-201ENST00000525252 377 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 YWHAQP7-201ENST00000603536 658 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 BTG3-AS1-201ENST00000626994 552 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 NF1P3-201ENST00000457709 450 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 HMGN2P13-201ENST00000476476 274 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 MTCO2P22-201ENST00000603246 681 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.93□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 SNORA7.2-201ENST00000364446 145 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RNU6-244P-201ENST00000391028 104 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 USP9YP34-201ENST00000453983 808 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 TEX41-222ENST00000597173 1134 ntTSL 1 (best) BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.92□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 RPL17P49-201ENST00000443728 411 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC2.91□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
NUP160Q12769 AC104984.2-201ENST00000582938 385 ntTSL 3 BASIC2.91□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms