Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL590783.1-201ENST00000424138 456 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC008537.2-201ENST00000596135 482 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC090092.1-201ENST00000530576 510 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC105339.2-201ENST00000558342 1091 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC007620.3-201ENST00000608131 497 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC104307.1-201ENST00000616142 196 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RNU1-93P-201ENST00000364704 169 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RNU6-1320P-201ENST00000390838 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RNU6-1269P-201ENST00000391139 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL158834.2-201ENST00000415731 696 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 SEC63P1-201ENST00000425785 1258 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RNU6-599P-201ENST00000459383 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RNU6-1193P-201ENST00000459461 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC025580.2-205ENST00000559960 552 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 LINC01355-202ENST00000604481 400 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RNU6-368P-201ENST00000620928 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RNU6-538P-201ENST00000622329 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL356277.3-201ENST00000432484 618 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL049838.1-201ENST00000563647 981 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 CMC2-208ENST00000564249 890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC069228.1-202ENST00000550272 737 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 MIR3199-2-201ENST00000636243 86 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC132825.8-201ENST00000640783 297 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC006026.1-201ENST00000444025 1803 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 HSFY1-202ENST00000309834 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 HSFY2-202ENST00000344884 1038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 GNGT1-204ENST00000430875 628 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 HSPE1P22-201ENST00000456856 327 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC006483.1-201ENST00000487308 313 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
HMGXB3Q12766 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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