Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC092641.1-201ENST00000440229 772 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AP002812.1-201ENST00000495378 474 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LINC01861-201ENST00000509568 537 ntTSL 4 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 PHBP14-201ENST00000512887 367 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RN7SKP13-201ENST00000515933 244 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 KLRF2-201ENST00000535540 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC090616.2-202ENST00000584248 222 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AL590099.1-201ENST00000615276 138 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 Hammerhead_HH10.1-201ENST00000620658 125 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 PCMTD1P7-201ENST00000634506 357 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
RBBP4Q09028 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.09□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MIR218-2-201ENST00000385006 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL162725.2-201ENST00000430545 748 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 FTH1P1-201ENST00000437933 532 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP000542.1-201ENST00000448473 371 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 PAXBP1P1-201ENST00000449315 447 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTERF3-203ENST00000522822 1148 ntTSL 2 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP003497.1-201ENST00000528472 562 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AP000442.2-202ENST00000531311 601 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC006116.8-203ENST00000587448 465 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AL591516.1-201ENST00000611326 274 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 DLEU1_2.1-201ENST00000617920 342 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ZRANB2-AS2-221ENST00000624050 629 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC092192.1-201ENST00000633154 1018 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 AC009093.8-201ENST00000641769 292 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 POSTN-209ENST00000541179 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MTND4P16-201ENST00000466108 1367 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
RBBP4Q09028 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 127.4 ms