Protein–RNA interactions for Protein: P08F94

PKHD1, Fibrocystin, humanhuman

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Length 4,074 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1P08F94 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LINC01326-201ENST00000495159 755 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 OR7L1P-201ENST00000456181 380 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AP000907.2-201ENST00000530827 353 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC011712.1-201ENST00000588959 234 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 TEX41-202ENST00000414256 604 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC013470.3-201ENST00000420252 1194 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 7SK.7-201ENST00000603504 247 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNF219-AS1-205ENST00000605996 792 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 MIR6715B-201ENST00000637172 77 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SLC10A5P1-201ENST00000379063 1306 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 SEPT7-205ENST00000432293 1362 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL021397.1-201ENST00000451806 248 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 ATG10-AS1-201ENST00000504846 648 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC006159.2-201ENST00000421965 692 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC104365.1-201ENST00000588835 394 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC116158.1-201ENST00000560231 2129 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
PKHD1P08F94 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.04□□□□□ -2.24
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