Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC01566-202ENST00000569242 2801 ntTSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 ETV1-202ENST00000399357 6096 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MAPK10-373ENST00000641983 6772 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 OR8D1-201ENST00000357821 1026 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNU5A-8P-201ENST00000364102 114 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 TEX41-204ENST00000423031 491 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPL21P89-201ENST00000444021 467 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC01846-201ENST00000505908 651 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MRPL49P2-201ENST00000521066 465 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 HOMER1-205ENST00000535690 642 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC010175.1-201ENST00000538219 224 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 CR383656.7-201ENST00000548164 174 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC087749.1-202ENST00000585020 566 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 KC877982.1-201ENST00000602313 470 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC008277.2-201ENST00000605196 797 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC245517.5-201ENST00000611529 162 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 PPP1R9A-208ENST00000456331 10090 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 SEC23A-202ENST00000537403 4215 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPL31P58-201ENST00000469001 379 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 PTP4A2-203ENST00000470404 575 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 FTH1P21-201ENST00000512179 511 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SHOC2Q9UQ13 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
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