Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 DHFRP3-201ENST00000455595 559 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC108517.1-201ENST00000512546 327 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC068397.1-201ENST00000560337 531 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC105224.1-201ENST00000587055 421 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL117336.2-201ENST00000602435 335 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 UTP20-201ENST00000261637 9025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AL592182.3-201ENST00000642132 3304 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 PCDH15-234ENST00000622048 6820 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RBBP6-203ENST00000381039 3384 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR52E2-201ENST00000321522 978 ntAPPRIS P1 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNA5SP118-201ENST00000410385 109 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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USP18Q9UMW8 RNU2-62P-201ENST00000410868 191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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USP18Q9UMW8 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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USP18Q9UMW8 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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USP18Q9UMW8 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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USP18Q9UMW8 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
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USP18Q9UMW8 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC010132.3-201ENST00000442788 2430 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ZNF33CP-201ENST00000432492 2030 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 CUL2-201ENST00000374746 3903 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 ASNSP1-201ENST00000518311 1939 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 GPX8-203ENST00000503787 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 Y_RNA.61-201ENST00000362835 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 GTSF1L-201ENST00000373003 835 ntAPPRIS P3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 GTSF1L-202ENST00000373005 459 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MIR1-2-201ENST00000384961 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
USP18Q9UMW8 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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