Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 NXPE1-204ENST00000536271 2289 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.98
LHX9Q9NQ69 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 FAR2P1-203ENST00000440931 187 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC013828.1-201ENST00000481845 158 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNF138P1-201ENST00000502765 546 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC108515.1-201ENST00000517407 525 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC023632.5-201ENST00000521010 491 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL353699.1-201ENST00000529078 365 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AL356022.1-201ENST00000557465 483 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 AP005433.1-202ENST00000580845 521 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC2.65□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.65□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 KLRC4-201ENST00000309384 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RNU6-906P-201ENST00000384700 70 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RPL23AP76-201ENST00000441860 458 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
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LHX9Q9NQ69 MTCO3P35-201ENST00000485582 781 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 LINC02049-201ENST00000490647 747 ntTSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
LHX9Q9NQ69 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC2.64□□□□□ -1.99
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