Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 LINC02100-201ENST00000512978 238 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC009163.5-201ENST00000575421 637 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 NPM1P10-201ENST00000398310 865 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 FABP5P3-201ENST00000437960 408 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 LINC01309-201ENST00000444795 492 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 LINC02316-201ENST00000553346 768 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 AC087272.1-201ENST00000523624 533 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 C3orf85-208ENST00000622536 925 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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ZBED3Q96IU2 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RN7SKP140-201ENST00000411196 284 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL049765.1-201ENST00000416237 573 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC004946.1-201ENST00000421825 751 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 OR4G11P-201ENST00000492842 939 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC106864.1-201ENST00000510655 640 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 RNU6-362P-201ENST00000516736 90 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC125611.2-201ENST00000551907 647 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC090618.1-201ENST00000571972 585 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
ZBED3Q96IU2 AC025811.1-201ENST00000604312 472 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
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