Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC006480.1-201ENST00000449887 378 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC004062.1-201ENST00000509926 645 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 SDCBP-207ENST00000520168 1097 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC079098.1-202ENST00000523150 573 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC128657.1-201ENST00000549459 145 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 LINC01269-201ENST00000553682 602 ntTSL 4 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AL161616.1-201ENST00000611867 286 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 CSRNP3-201ENST00000314499 11788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 SNORA70F-201ENST00000384142 135 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 TRAV12-2-201ENST00000390437 445 ntAPPRIS P1 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 LINC00276-201ENST00000417751 596 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 NDUFA5P4-201ENST00000436704 385 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 LINC02469-201ENST00000506460 741 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 GYPA-208ENST00000512064 441 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AL133255.1-201ENST00000606374 441 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 LINC00550-201ENST00000629293 3434 ntTSL 1 (best) BASIC4.39□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
ANKRD53Q8N9V6 SGO1-AS1-203ENST00000455626 2041 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms