Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC021851.1-201ENST00000608537 1082 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RNA5SP184-201ENST00000411071 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC009276.1-201ENST00000422042 253 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MTND4LP3-201ENST00000468320 276 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC00888-204ENST00000487386 421 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 PDCD10-214ENST00000487947 716 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AP006248.3-201ENST00000623580 594 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC098679.5-201ENST00000624394 571 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL139220.2-223ENST00000625982 921 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MIR21-201ENST00000362134 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SLC9B1P2-201ENST00000398120 1184 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL590502.1-201ENST00000433019 505 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 OR51B8P-201ENST00000449892 769 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RBM43P1-201ENST00000476891 1081 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC02229-201ENST00000508486 661 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 XKRY-201ENST00000510392 1100 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC090888.1-201ENST00000561335 1141 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC067747.1-201ENST00000608026 250 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC131280.1-202ENST00000624067 4211 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 PABPC1P9-201ENST00000426076 1612 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AMY2B-208ENST00000610648 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 CFLAR-AS1-201ENST00000415011 1072 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC107081.2-201ENST00000425779 802 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
IMPG1Q17R60 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.4 ms