Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL589740.1-205ENST00000635561 565 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MIR607-201ENST00000385241 96 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC01765-201ENST00000448680 491 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 HAUS1P3-201ENST00000523909 662 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 ALDH3A2-208ENST00000571163 590 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPS15AP1-201ENST00000457423 391 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC092745.2-201ENST00000537764 620 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC079584.2-201ENST00000548756 515 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL049737.1-201ENST00000413920 1403 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MTAPP1-201ENST00000489154 819 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SCN9AQ15858 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AP000567.1-201ENST00000406413 156 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC107398.2-201ENST00000508081 601 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC007001.1-201ENST00000590912 670 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL160411.1-201ENST00000429853 400 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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SCN9AQ15858 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 CBX3P2-202ENST00000583365 535 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC091046.2-201ENST00000620775 665 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AL606534.3-201ENST00000437499 373 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 VN1R80P-201ENST00000597126 338 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 LINC00976-201ENST00000625513 783 ntTSL 3 BASIC2.32□□□□□ -2.04
SCN9AQ15858 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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