Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 FAM25E-202ENST00000608562 189 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL020991.1-201ENST00000612314 373 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL118556.2-201ENST00000614375 824 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR7155-201ENST00000615925 56 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SPATA17-AS1-201ENST00000415765 420 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC007161.1-201ENST00000418534 1061 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC01040-201ENST00000425048 666 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL445488.1-202ENST00000430623 545 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC093720.1-201ENST00000505681 714 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC00824-201ENST00000517583 805 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC022915.1-201ENST00000521660 289 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC009509.1-201ENST00000536317 1110 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC004147.3-201ENST00000577709 375 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR4436B2-201ENST00000581415 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR4436B1-201ENST00000583272 91 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC016769.4-201ENST00000616893 535 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RSL24D1P1-201ENST00000404972 493 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 HNMT-204ENST00000410115 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 VN1R34P-201ENST00000447387 883 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC074386.1-201ENST00000476560 767 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 OR8K2P-201ENST00000524645 927 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VAMP3Q15836 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
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