Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 NDST1-AS1-201ENST00000519040 368 ntTSL 2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AP001528.2-201ENST00000528660 1156 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 COX6CP3-201ENST00000580869 223 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC022706.1-202ENST00000585387 540 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL136981.2-201ENST00000617319 734 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL390862.1-201ENST00000635467 1469 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL157884.2-201ENST00000424177 551 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC097493.1-201ENST00000463958 372 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC091826.2-201ENST00000504034 412 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL589740.1-208ENST00000606913 812 ntTSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 PAPPA-AS1-201ENST00000445861 2450 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 LINC01592-202ENST00000518540 2367 ntTSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 C1orf185-201ENST00000371759 915 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 UBE2D3P2-201ENST00000424409 445 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SPIC-201ENST00000551346 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC097467.3-208ENST00000593486 670 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC022336.2-201ENST00000568966 2538 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNU6-618P-201ENST00000363518 112 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 OR51AB1P-201ENST00000429046 620 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC012355.1-201ENST00000450290 769 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 BZW1P2-201ENST00000473537 826 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AB015752.1-201ENST00000521975 578 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
HMGN3Q15651 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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