Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 LINC02126-202ENST00000563754 750 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RPL36A-210ENST00000614077 881 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC078880.5-201ENST00000617845 421 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
SS18Q15532 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RNU6-207P-201ENST00000384137 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC119800.1-201ENST00000429871 423 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MTCYBP15-201ENST00000433123 1127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC112695.1-201ENST00000504213 592 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC079340.1-201ENST00000504799 552 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC106744.2-202ENST00000515123 448 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 OR4R1P-201ENST00000529879 463 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 ZNF971P-201ENST00000562068 1249 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 AC060766.3-201ENST00000591442 263 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC1.85□□□□□ -2.11
SS18Q15532 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
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SS18Q15532 MLLT3-201ENST00000380321 708 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 FO393414.1-201ENST00000428697 1184 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC135721.1-201ENST00000497954 479 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC008243.1-202ENST00000506527 481 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
SS18Q15532 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
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