Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNU6-551P-201ENST00000516661 103 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC104009.1-203ENST00000531304 571 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC007115.1-201ENST00000546853 234 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 PSMA4-206ENST00000558341 719 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AGL-204ENST00000370161 6923 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 RPA3-203ENST00000401447 414 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ATP5F1P6-201ENST00000402768 767 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 ACTR3BP6-201ENST00000422332 1241 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC026801.2-201ENST00000515352 425 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 A2ML1-AS1-201ENST00000537288 452 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC022069.1-201ENST00000582910 658 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AL512625.3-207ENST00000609749 477 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SYCP1Q15431 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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SYCP1Q15431 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 IVNS1ABP-201ENST00000367497 746 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNA5SP354-201ENST00000391247 136 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL136372.1-201ENST00000403060 228 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC005002.1-201ENST00000447458 540 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 BCL2A1-202ENST00000335661 809 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RNU6-443P-201ENST00000384780 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC244453.4-201ENST00000419150 388 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 LINC01986-201ENST00000440867 590 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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SYCP1Q15431 AL589880.1-201ENST00000448271 287 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RPS20P24-201ENST00000457473 361 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 HIGD1AP6-201ENST00000521833 279 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SYCP1Q15431 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
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