Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 NRK-204ENST00000540278 1687 ntTSL 2 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.18□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.18□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.18□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 ZCCHC7-202ENST00000336755 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 R3HCC1L-201ENST00000298999 3379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 QKI-202ENST00000361195 1063 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNA5SP113-201ENST00000410486 84 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL772161.1-201ENST00000439130 476 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC091868.1-201ENST00000508746 304 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR5D15P-201ENST00000531671 942 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC012443.1-201ENST00000605605 231 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC069234.5-201ENST00000611056 416 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL049539.1-201ENST00000611964 459 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC091953.3-201ENST00000623220 236 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC00862-201ENST00000367355 1417 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL391684.1-202ENST00000641293 1636 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.17□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 DNAH12-202ENST00000351747 9542 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR10D3-202ENST00000641351 3561 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 OR10D3-203ENST00000641546 3566 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MIR585-201ENST00000384887 94 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC018630.2-202ENST00000422992 927 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 NRBF2P3-201ENST00000432731 865 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPS20P20-201ENST00000460498 340 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC092324.1-201ENST00000468671 324 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC231760.1-201ENST00000498002 260 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 RN7SKP276-201ENST00000516242 268 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
RAB39AQ14964 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.4 ms