Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MTCO1P39-201ENST00000426148 480 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 USP12PX-201ENST00000432383 1057 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC104688.1-201ENST00000447158 419 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC106796.1-201ENST00000577173 615 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC005498.1-201ENST00000592125 465 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC025588.3-201ENST00000604182 274 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL671511.2-201ENST00000611838 659 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 WFDC11-203ENST00000618797 561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SMCO1Q147U7 LCA5L-218ENST00000485895 2551 ntTSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 CRP-202ENST00000368110 667 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNU6ATAC34P-201ENST00000408879 121 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC087857.1-201ENST00000425894 467 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC01867-201ENST00000435357 604 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC107626.1-201ENST00000471084 183 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC00603-201ENST00000507027 733 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 COX6CP8-201ENST00000522620 226 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC090116.1-201ENST00000615679 446 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 TPTE2P4-201ENST00000258589 1605 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 TAS2R13-201ENST00000390677 1637 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 FGF7P5-201ENST00000441829 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 MTND2P19-201ENST00000449129 1012 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC092155.2-201ENST00000454675 477 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC011998.3-201ENST00000457053 254 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL450336.1-201ENST00000605180 586 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 LMNTD1-204ENST00000458174 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 DDX10P1-201ENST00000448545 1933 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
SMCO1Q147U7 EDDM3A-201ENST00000326842 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms