Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 LINC02311-201ENST00000556144 383 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AP005901.2-201ENST00000581690 525 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC096577.2-201ENST00000611455 153 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 MIR1322-201ENST00000638013 71 ntBASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.22□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 TRIQK-201ENST00000378861 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.89
RFTN1Q14699 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 UBA5-201ENST00000264991 2850 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 ZNF804A-202ENST00000613975 3986 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 PCDH9-AS4-201ENST00000456459 436 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC069029.1-201ENST00000558736 263 ntTSL 2 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 OR8H2-202ENST00000618136 1038 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC017037.3-201ENST00000625016 472 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.21□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 MYO16-AS2-201ENST00000412809 436 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 LINC01680-201ENST00000434983 299 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC019330.1-202ENST00000440609 504 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 RPS3AP43-201ENST00000479743 781 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC021736.1-201ENST00000521143 563 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 LYZ-203ENST00000549690 669 ntTSL 2 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 MYL12B-204ENST00000584539 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.2□□□□□ -1.9
RFTN1Q14699 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms