Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 AC012625.1-201ENST00000515153 625 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 C6orf10-201ENST00000375007 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 MORF4L1P6-201ENST00000418771 268 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 OR9N1P-202ENST00000494289 481 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 OR4H6P-202ENST00000603819 340 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC1.98□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNU6-77P-201ENST00000410554 91 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC005005.2-201ENST00000420779 380 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC092162.2-204ENST00000451851 566 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC109486.1-201ENST00000486833 374 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 ZFAT-AS1_1.1-201ENST00000620907 79 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC092184.1-201ENST00000625042 715 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL163152.1-201ENST00000642001 374 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 PLCB1-IT1-202ENST00000451443 251 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 DENND6A-AS1-201ENST00000470427 364 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC126768.3-201ENST00000514519 560 ntTSL 4 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC040174.2-201ENST00000602701 465 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 AL356118.1-201ENST00000635272 1078 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
MDC1Q14676 RNU6-76P-201ENST00000384060 104 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 RNU6-883P-201ENST00000384597 107 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC006548.1-201ENST00000427470 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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MDC1Q14676 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
MDC1Q14676 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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