Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 IFI16-201ENST00000295809 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 COMMD10-206ENST00000515539 869 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
SPTAN1Q13813 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RPL9P9-201ENST00000418824 636 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RN7SKP49-201ENST00000516675 260 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL589765.3-201ENST00000446084 462 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC090970.3-201ENST00000612566 866 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 FKBP7-205ENST00000434643 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RFC5P1-201ENST00000454419 874 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC121764.2-201ENST00000469806 587 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AP000787.2-201ENST00000604432 568 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 LRRC6-212ENST00000618342 1754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC092451.2-201ENST00000538746 658 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC243773.3-201ENST00000613270 256 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 NUP58P1-201ENST00000502546 1738 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 TMEM27-201ENST00000380342 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC099566.1-204ENST00000413825 943 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 VN1R74P-201ENST00000613259 503 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AP002345.1-201ENST00000456493 928 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 CD69-203ENST00000536709 1020 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 CCDC30-201ENST00000340612 2664 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 ART3-202ENST00000349321 1528 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RPS3AP22-201ENST00000488297 769 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL450326.2-201ENST00000421913 1962 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 XKRYP4-201ENST00000414395 483 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 XKRYP5-201ENST00000449659 483 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
SPTAN1Q13813 AC095050.2-201ENST00000510748 1458 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
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