Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 RN7SKP34-201ENST00000516142 244 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 AL353148.1-204ENST00000426752 477 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
SHROOM2Q13796 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 AL354943.1-201ENST00000572103 781 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.71□□□□□ -1.97
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SHROOM2Q13796 HPVC1-201ENST00000629899 1198 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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SHROOM2Q13796 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.7□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 AC100801.1-201ENST00000517368 517 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 PPFIA2-AS1-210ENST00000553197 875 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 AC105429.2-201ENST00000610567 517 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 AC092159.4-201ENST00000624944 550 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
SHROOM2Q13796 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
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