Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 PMCH-201ENST00000329406 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 CASP1-203ENST00000446369 948 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 SNORD121B-201ENST00000458838 81 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 FILIP1L-206ENST00000471562 2854 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC022483.1-201ENST00000514020 567 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AP003730.2-201ENST00000526385 546 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC244517.5-201ENST00000624139 722 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 MYCBP2-AS1-209ENST00000631152 412 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 OR6C1-202ENST00000642104 2055 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RABGGTB-202ENST00000370826 512 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 YPEL5P1-201ENST00000419731 367 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 THAP5P1-201ENST00000439089 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL137847.2-201ENST00000458111 527 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC013799.1-201ENST00000531157 348 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC009094.1-201ENST00000564443 426 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC034268.2-201ENST00000571784 482 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC118755.1-201ENST00000572923 195 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AP001429.1-201ENST00000602568 530 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL158211.4-201ENST00000606988 584 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 MUC15-201ENST00000281268 2968 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL513185.3-201ENST00000433335 1300 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 RPS3AP24-201ENST00000407896 734 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL158156.1-201ENST00000422509 473 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL445490.2-201ENST00000440492 441 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
ALCAMQ13740 AC112653.1-201ENST00000443851 386 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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