Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

Predictions only

Length 790 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTND1P20-201ENST00000430341 950 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 HSPE1P28-201ENST00000443139 211 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 UBE2Q2P9-201ENST00000490086 202 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AP001086.1-201ENST00000494882 321 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RN7SKP60-201ENST00000516985 239 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC018437.2-201ENST00000517369 389 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC02442-202ENST00000540761 382 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SETP7-201ENST00000552169 453 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC097065.2-201ENST00000608159 533 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR483-201ENST00000385070 76 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
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CDH18Q13634 AL117351.1-201ENST00000438864 766 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 LINC01698-201ENST00000443636 727 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 Z75741.1-201ENST00000446793 314 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 NREP-AS1-201ENST00000503242 411 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 THAP6-205ENST00000504190 1004 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC118465.1-201ENST00000513820 1271 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MTCO1P47-201ENST00000523889 1271 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC239860.2-201ENST00000525886 270 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC011260.1-201ENST00000578420 472 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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CDH18Q13634 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC122133.1-201ENST00000613964 233 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AL022578.1-201ENST00000439330 1433 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 AC012321.1-201ENST00000561622 1588 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
CDH18Q13634 STAU2-207ENST00000519961 3928 ntTSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
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