Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 LINC02430-201ENST00000504755 476 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNA5SP121-201ENST00000516537 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 PTP4A1P6-201ENST00000531034 478 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 OR6C3-203ENST00000641740 1093 ntAPPRIS P1 BASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL078590.1-201ENST00000412602 479 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC012498.1-201ENST00000424037 437 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MSMB-201ENST00000581478 386 ntTSL 1 (best) BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC009452.1-201ENST00000640823 606 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 IGLV5-37-201ENST00000390300 374 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL157938.2-203ENST00000589540 931 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 DDX43P2-201ENST00000604753 1354 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 OFD1P12Y-201ENST00000427963 1207 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 MTCO3P13-201ENST00000577757 781 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ATRQ13535 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTCO1P14-201ENST00000441695 1559 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 XKRY2-202ENST00000623874 1581 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 XKRY-202ENST00000624960 1581 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ATRQ13535 EBAG9P1-201ENST00000418955 543 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC234781.2-201ENST00000426370 994 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RPS6P12-201ENST00000432491 726 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC022431.1-201ENST00000450941 438 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC097512.1-203ENST00000506425 957 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC011008.1-201ENST00000522026 439 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC105031.3-201ENST00000524359 616 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC104581.2-201ENST00000572227 430 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 CFL2-202ENST00000341223 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC021237.1-201ENST00000504175 1643 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 DEFB129-201ENST00000246105 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AP000753.2-201ENST00000540307 423 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ATRQ13535 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AL162414.1-201ENST00000426204 744 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 ARPC3P1-201ENST00000437218 533 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 MTCYBP17-201ENST00000503579 789 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 TIMM9-203ENST00000555061 598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC103987.3-201ENST00000582071 292 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ATRQ13535 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
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