Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SNORA70-201ENST00000384436 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RPS4XP9-201ENST00000405151 780 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 BX323014.1-201ENST00000412876 237 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL356134.1-201ENST00000419815 373 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC109464.3-201ENST00000509456 204 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MIR3691-201ENST00000578066 90 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC209154.1-201ENST00000582156 337 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC008794.2-201ENST00000587779 293 ntTSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 TEX41-238ENST00000604253 709 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AL390240.1-201ENST00000612950 384 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AC025034.2-201ENST00000623264 286 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 FAM197Y3-202ENST00000427622 2325 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 FAM197Y7-202ENST00000433321 2325 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 EMSY-207ENST00000525919 4074 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 MS4A1-201ENST00000345732 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
TOP3AQ13472 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 PARD3-204ENST00000374768 799 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU6-432P-201ENST00000384196 109 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNA5SP107-201ENST00000411358 122 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL590705.3-201ENST00000416066 474 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TBCAP2-201ENST00000416175 326 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL355433.1-201ENST00000422804 300 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPL35AP22-201ENST00000436855 335 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
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TOP3AQ13472 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SNRPCP2-201ENST00000504370 475 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC004980.4-201ENST00000513375 203 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 MIR4691-201ENST00000583764 85 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AC245389.1-201ENST00000605141 529 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 NAA60-237ENST00000615865 326 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ST7-212ENST00000422922 1887 ntTSL 5 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SON-204ENST00000381692 2463 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 ETV1-205ENST00000405192 4402 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.71
TOP3AQ13472 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.39□□□□□ -1.71
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